MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaerolinea thermophila UNI-1

Total Repeats: 5611

< Previous123456789101112Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014960	GGGC	2	8	3480975	3480982	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5502	NC_014960	CAA	2	6	3483239	3483244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_014960	A	7	7	3483294	3483300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_014960	TCC	3	9	3487359	3487367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_014960	CCA	2	6	3487420	3487425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5506	NC_014960	A	6	6	3487513	3487518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_014960	CTC	2	6	3487856	3487861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5508	NC_014960	GAAG	2	8	3487897	3487904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_014960	CAT	2	6	3488076	3488081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_014960	C	6	6	3491904	3491909	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5511	NC_014960	A	7	7	3491915	3491921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_014960	AGA	2	6	3493067	3493072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_014960	TAAGT	2	10	3493081	3493090	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_014960	ATAA	2	8	3493097	3493104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_014960	TCT	2	6	3493246	3493251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_014960	T	6	6	3493325	3493330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_014960	T	7	7	3493347	3493353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_014960	AGG	2	6	3493415	3493420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_014960	T	6	6	3496079	3496084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_014960	T	6	6	3496090	3496095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_014960	CTC	2	6	3496108	3496113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5522	NC_014960	AG	3	6	3496711	3496716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_014960	AAAT	2	8	3497015	3497022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_014960	AC	3	6	3497048	3497053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5525	NC_014960	GC	3	6	3497166	3497171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5526	NC_014960	GTG	2	6	3497202	3497207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_014960	A	6	6	3497234	3497239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_014960	GGC	2	6	3497240	3497245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_014960	GCC	2	6	3497256	3497261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5530	NC_014960	CT	3	6	3498731	3498736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5531	NC_014960	ATC	2	6	3498747	3498752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_014960	GA	3	6	3499727	3499732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_014960	GAT	2	6	3499748	3499753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_014960	TAT	2	6	3499783	3499788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_014960	CCAG	2	8	3502725	3502732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5536	NC_014960	TCC	2	6	3504178	3504183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5537	NC_014960	AAT	2	6	3504234	3504239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_014960	TAT	2	6	3504247	3504252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_014960	A	6	6	3504256	3504261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_014960	CTTT	2	8	3504269	3504276	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5541	NC_014960	GAT	2	6	3504281	3504286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_014960	GAAA	2	8	3504310	3504317	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_014960	CT	3	6	3504320	3504325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5544	NC_014960	CTT	2	6	3504933	3504938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_014960	CCA	2	6	3504972	3504977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5546	NC_014960	ATC	2	6	3504983	3504988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_014960	GAT	2	6	3505003	3505008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_014960	GGC	2	6	3505018	3505023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_014960	GAG	2	6	3505024	3505029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_014960	TGG	2	6	3505045	3505050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_014960	A	7	7	3505059	3505065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_014960	CTC	2	6	3506159	3506164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5553	NC_014960	C	6	6	3506166	3506171	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5554	NC_014960	TCT	2	6	3506173	3506178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_014960	CT	3	6	3506177	3506182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5556	NC_014960	TCCT	2	8	3506183	3506190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5557	NC_014960	T	6	6	3506190	3506195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_014960	CCA	2	6	3506207	3506212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5559	NC_014960	CCG	2	6	3506309	3506314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5560	NC_014960	CAG	2	6	3506316	3506321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_014960	C	6	6	3506329	3506334	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5562	NC_014960	AGT	2	6	3506525	3506530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_014960	CG	3	6	3506561	3506566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5564	NC_014960	TGG	2	6	3506585	3506590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_014960	GCC	2	6	3506611	3506616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5566	NC_014960	CGG	2	6	3506828	3506833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_014960	CAC	2	6	3506871	3506876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5568	NC_014960	CGCGG	2	10	3506889	3506898	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5569	NC_014960	T	6	6	3507231	3507236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_014960	ACC	2	6	3507237	3507242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5571	NC_014960	TC	3	6	3507247	3507252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5572	NC_014960	AGG	2	6	3507286	3507291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_014960	TTC	2	6	3507365	3507370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_014960	CCT	2	6	3508434	3508439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5575	NC_014960	AGGT	2	8	3508653	3508660	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_014960	TTTC	2	8	3512301	3512308	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5577	NC_014960	TTC	2	6	3512360	3512365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_014960	TCT	2	6	3512371	3512376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_014960	GGAG	2	8	3512865	3512872	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_014960	GTC	2	6	3513553	3513558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_014960	AGCG	2	8	3513562	3513569	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5582	NC_014960	GCG	2	6	3513578	3513583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_014960	TCCC	2	8	3513601	3513608	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5584	NC_014960	TG	3	6	3513648	3513653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_014960	A	7	7	3513765	3513771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_014960	C	6	6	3513777	3513782	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5587	NC_014960	GGCA	2	8	3513819	3513826	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5588	NC_014960	A	6	6	3514650	3514655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_014960	GC	3	6	3514825	3514830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5590	NC_014960	AAGGG	2	10	3514873	3514882	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_014960	C	6	6	3518584	3518589	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5592	NC_014960	C	6	6	3520992	3520997	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5593	NC_014960	CAC	2	6	3521027	3521032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5594	NC_014960	A	8	8	3525935	3525942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_014960	TAT	3	9	3525953	3525961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_014960	CTT	2	6	3525974	3525979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_014960	A	8	8	3526180	3526187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_014960	A	7	7	3526251	3526257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_014960	A	8	8	3526321	3526328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_014960	A	8	8	3526392	3526399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_014960	C	6	6	3526428	3526433	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5602	NC_014960	CACTT	2	10	3526452	3526461	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5603	NC_014960	A	7	7	3526464	3526470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_014960	GAA	2	6	3526592	3526597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_014960	CTC	2	6	3526626	3526631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5606	NC_014960	CG	3	6	3529554	3529559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5607	NC_014960	AGA	2	6	3529678	3529683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_014960	TCC	2	6	3530740	3530745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5609	NC_014960	TC	5	10	3530751	3530760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5610	NC_014960	CTGG	2	8	3531516	3531523	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5611	NC_014960	T	6	6	3531592	3531597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous123456789101112Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.